- Par défaut, le niveau fonctionnel est « Windows 2000 mixte ». Ce niveau fonctionnel permet de contenir au sein du domaine des contrôleurs de domaine Windows 2003, Windows 2000 et également des contrôleurs secondaires de domaine Windows NT 4.0. Ce niveau fonctionnel permet une grande compatibilité entre chaque contrôleur de domaine de générations différentes. Il y a quand même un revers de la médaille, ce niveau fonctionnel offre le moins de fonctionnalités.

- Si le domaine ne contient que des contrôleurs de domaine sous Windows 2000 et Windows 2003 on peut le passer en niveau fonctionnel « Windows 2000 natif ». Ce niveau fonctionnel permet d’activer certaines fonctionnalités du domaine dans Active Directory. Ce niveau ne permet pas encore d’activer toutes les fonctionnalités disponibles. Il faut pour cela l’augmenter.

- Le niveau fonctionnel le plus élevé pour un domaine est le niveau fonctionnel « Windows Server 2003 ». Il n’est accessible uniquement si le domaine ne possède que des contrôleurs de domaine sous Windows 2003 server. Avec ce niveau fonctionnel, toutes les fonctionnalités Active Directory pour le domaine sont disponibles.

- Il existe également un niveau fonctionnel « Windows 2003 server version préliminaire ». Ce niveau fonctionnel est utilisable si le domaine contient des contrôleurs de domaine sous NT 4.0 et des contrôleurs de domaine sous Windows 2003 server. Ce niveau fonctionnel est uniquement utilisé dans le cadre d’une migration.

- Par défaut, le niveau fonctionnel est en « Windows 2000 », ce niveau permet une compatibilité avec des contrôleurs de domaine sous NT4.0, Windows 2000 et Windows 2003. En revanche il n'apporte pas de fonctionnalités nouvelles.

- Le niveau fonctionnel qui introduit toutes les nouveauté est le niveau « Windows Server 2003 ». Ce niveau de fonctionnalité requiert que tous les contrôleurs de domaines soient sous Windows 2003 Server, de plus, il sera impossible d'ajouter un contrôleur de domaine avec une version de Windows postérieure à Windows 2003 Server.

- Le dernier niveau de fonctionnalités de forêt est le niveau « Windows 2003 server version préliminaire ». Ce niveau fonctionnel est utilisé lors de migrations de NT 4.0 vers Windows 2003 Server.